8.06.2026

Training to explain things logically and concisely in English

 My original explanation

The range of the QTL for Ca on Pv04 is 33 Mb long. One chromosome is typically about 50 Mb long, so this QTL is taking effectively three-fifths of the whole chromosome. However, when I visualize it, it looks much shorter. That is because the visualization is based on the genetic distances, not physical distance. The QTL that spans 11-44 Mb is only 5 cM long because it is in the middle of the chromosome, where very few crossovers happen. So, that is why the discrepancy between the QTL range based on the physical position of the markers and the visualized range between them based on the genetic distance appear so different. 

Improved version:

The QTL for Ca on Pv04 spans 33 Mb. Because a chromosome in common bean is typically about 50 Mb long, this QTL covers roughly three-fifths of the chromosome. However, it appears much shorter in the visualization because the plot is based on genetic distance rather than physical distance.

Although the QTL extends from 11 to 44 Mb, it spans only 5 cM. This region is located near the middle of the chromosome, where recombination is infrequent. As a result, a large physical interval corresponds to a relatively short genetic distance. This explains the apparent discrepancy between the QTL interval defined by the physical positions of the markers and its visualized length based on genetic distance.


Training for me

Your underlying reasoning is already strong. The main issue is not logic itself, but compressing the logic into a cleaner sequence and choosing more precise scientific phrasing.

The most suitable training for you would focus on four areas.

First, practise explaining one idea in a fixed causal structure:

Observation → explanation → mechanism → conclusion

For your QTL example:

  • Observation: The QTL spans 33 Mb but looks short in the figure.

  • Explanation: The figure uses genetic distance, not physical distance.

  • Mechanism: Recombination is infrequent near the chromosome centre.

  • Conclusion: A large physical interval can correspond to a short genetic interval.

This structure suits you because your original explanation contained all four elements, but they were partly repeated and distributed across several sentences.

Second, practise separating the specific case from the general principle. A strong scientific explanation often moves like this:

  1. State the specific result.

  2. State the general principle.

  3. Apply the principle back to the result.

For example:

The QTL spans 33 Mb physically but only 5 cM genetically. Genetic and physical distances are not proportional, particularly in regions with low recombination. Because this interval lies near the chromosome center, its large physical span corresponds to a short genetic distance.

This pattern is especially useful in presentations and discussions because it helps the listener understand not only what happened, but why the same phenomenon may occur elsewhere.

Third, practise replacing conversational expressions with standard scientific verbs and nouns. Your English is understandable, but some phrases are translated too directly from spoken reasoning.

Examples from your draft:

  • “is taking three-fifths” → “covers roughly three-fifths”

  • “very few crossovers happen” → “recombination is infrequent”

  • “looks much shorter” → “appears much shorter”

  • “the discrepancy … appear so different” → “this explains the discrepancy”

  • “the range of the QTL” → “the QTL interval” or “the QTL spans”

A useful exercise is to build a personal phrase bank organized by function:

  • describing extent: “spans,” “covers,” “extends from”

  • explaining causes: “because,” “due to,” “as a result of”

  • describing relationships: “corresponds to,” “is associated with,” “does not scale proportionally with”

  • interpreting figures: “appears,” “is represented as,” “the plot is based on”

  • concluding: “This explains why,” “As a result,” “Therefore”

Fourth, practice removing sentences that merely restate the same relationship. Your original version explains the physical–genetic distance discrepancy several times:

it looks much shorter
the visualization is based on genetic distances
it is only 5 cM long
that is why the discrepancy appears different

All are relevant, but the final sentence repeats what the previous sentences have already established. A useful editing test is:

Does this sentence add a new fact, explain a mechanism, or draw a necessary conclusion?

If it does none of these, delete or merge it.

A training routine particularly suited to you would be:

  1. Write the explanation naturally without restricting yourself.

  2. Label each sentence: observation, evidence, mechanism, interpretation, or conclusion.

  3. Remove repeated labels containing the same information.

  4. Rewrite the explanation in three sentences.

  5. Rewrite it again in one sentence.

  6. Explain it aloud without looking at the text.

For your example, the three-sentence version might be:

The Ca QTL on Pv04 spans 33 Mb physically, covering roughly three-fifths of the chromosome, but it appears much shorter in the visualization. This is because the plot represents genetic rather than physical distance, and the 11–44 Mb interval spans only 5 cM. Because recombination is infrequent near the chromosome centre, a large physical interval can correspond to a short genetic distance.

The one-sentence version would be:

Although the Ca QTL covers 33 Mb on Pv04, it appears short in the visualization because low recombination near the chromosome centre compresses this large physical interval into only 5 cM of genetic distance.

Your highest-priority training is therefore not basic English grammar. It is information structuring, scientific phrase selection, and compression. You already identify the relevant facts and causal mechanism correctly; the next step is learning to package them in the order most useful to the listener.


8.02.2026

盛夏にCafe Restaurant ASAL でイラン料理

ふと思い立って、イラン・ペルシャ料理を食べに行ってきた。

暑すぎて、目的地の途中にあるここでランチして涼もうという魂胆であった…。

いやしかし暑い。サウナである。自転車に乗るのはたぶん悪手。熱中症にホントに気をつけねばならない。。

牛肉、玉ねぎ、スパイスを入れて作ったケバブを香ばしく焼いたものに、サフランライス! ライスの上の部分がたっぷりの油でこんがりと焼いてあって、フライドポテトのようなギルティな組み合わせだけど美味しい…。暑さで食欲不振だけど食が進みました。ケバブもジューシーで美味しかった。

そしてヨーグルトドリンク。アラビア語の名前で思い出せないが…炭酸水、ヨーグルト、牛乳、ミントを入れた爽やかなお味!夏の定番だそう。(ん?イランって夏しかないのでは?と思ったら、明確な四季があるようだ…!) 砂糖はたぶん入っていなくて、甘くなくて酸っぱくて美味しかった。ヨーグルトなのでお腹ゴロゴロも多分ないだろうし… 発見でした。






7.30.2026

ジジのお世話大作戦 ーお留守番猫ちゃんをなだめつつ、猫のいる暮らしを体験してとろけました

帰ってきたら猫がいる、在宅ワークで猫がいる生活を体験しました…

友人が旅行で一週間留守にして、その間、飼っている猫ちゃん「ジジ」はお留守番する、というので、3人でチームを組んで、交代で猫ちゃんのお世話しに行った。

ジジは、実は私が以前動物愛護センターでボランティアしていた時に引き取ってもらった子で、私も子猫時代にセンターでお世話していた。からの、大人猫になって、家族が見つかって、幸せに暮らしているところで再会、ということになったので、すごく嬉しかった~

動物愛護センターで子猫の時から育てられた猫たちは、たいてい人に慣れているのでとても人懐こい。ジジも同様だった。

なんでも、友人一家が愛護センターに猫を選びに行くときに、譲渡室で、子猫がたくさんわらわらしている中、ジジは友人の肩に乗ってきたのだそうだ。それで心を射抜かれた一家は、「うん、君だ」となったらしい。肩に乗ってくるなんて、ピカチュウのようですな。ジジのアピール作戦大成功、友人一家の新しいメンバーとなったそうな。

動物シェルターで、人間が動物を選ぶのではなく動物が人を選ぶ、という動画を見たことがある。感動ものだ。一列に並べられた椅子に里親候補の人たちが座っており、保護犬や保護猫がその前に放たれる。でも人間は、声をかけたり触ったりしてはいけない。犬ちゃん(あるいは猫ちゃん)に、愛情こもった視線を向けながら、じっと待つのだ。犬ちゃん猫ちゃんは、「君の家族を見つけてごらん」の言葉をきちんと理解し、人間たちを見つめたりにおいをかいだりしながら、最終的に一人の人に顔を押し付けて「あなたです!」と選ぶ。選ばれた人は泣き出さんばかりに歓喜し、その子を全身で受け止める。そういうエピソードを思い出した。

ほぼ同じ感じで家族をゲットしたジジは、可愛いがられているんだろうなぁ…とよくわかるお宅で、ニャーニャー鳴きながら待っていた。

普段大人数の家族がいることに慣れていて、初めてのお留守番。やはり寂しいんだろうなと思った。

玄関に続くドアのそばでしきりに鳴いていたが、私の姿を見るなり、「この人じゃない」とばかりに玄関のほうを見てまた鳴き始めた。やっぱり家族の人じゃないってわかるんだな。

一日目は、私の滞在時間が短かったので、ごはんをあげてトイレ掃除して、オモチャで遊んで、という感じ。ハンティングゲームを永遠にしていた。私がしゃがんでいる足の間に入ってきて獲物を狙う。知らない人への警戒心とか何もなくて可愛い。番犬(番猫?)にはならないけど、可愛い。

一回、全身の力を込めてすり寄ってきて撫でて撫でて、ってしてきたのもすごく可愛かった。撫でられるのも自分の気の向いたとき、というのがすごく猫らしい。

帰る時はまたニャーニャー鳴いて、「帰らないで」アピールをされた。寂しいよね。交代で人が来る約2時間の間以外は、一日ずっと一人だもん。うぐぅ……。後ろ髪を引かれまくりながら帰った。

なので二日目はもっと長くいてあげようと思い、パソコンや勉強道具を持参した。相変わらず、玄関に続くドアの前でニャーニャー鳴いて待っていた。今日は長くいてあげるからねーと声掛けしつつ。すり寄っては離れ、抱っこもお気に召さず、ちょっと拗ねているような感じもした。留守番4日目となっていたので、ストレスが溜まっているのかもしれないなと思った。動物を飼うと旅行とか難しくなると聞くけど、本当にそうだなと思った…。

美味しいベーグル屋さんが近所にあると聞いたので行ってみて、クリームチーズ&サーモンサンドを買った。それを私が目の前で広げても、ジジは興味を示すものの、手を出したり食べようとしたりすることもなく、とてもお利口。

そして、私が机の上にパソコンを広げると…! 本当にもう、条件反射のようにそこへ来て、キーボードの上にどっかりと座る。来た来た来た。まるで猫ホイホイ。まだ何も作業を始められないうち、キーボードがまるごとジジの大きな体に占領され、奇妙なアルファベットの羅列が入力され始める。そして、Shiftキーが連続して押されると出るエラーみたいなのまで出た。これが世に聞く猫ハラかぁーーーと、初めての体験にうっとりしてしまった。ジジの飼い主さんに後で聞いたら、「それ、よくするんだよね」と言っていた。可愛い…。これをしたら構ってもらえると知っているのだろうか?? キーボードを占領されて仕事にならないのでとりあえず撫でる。ジジの思うツボだと、分かってはいるのだが。黒々した毛並みが美しい。床を転がったりしている全身だけど、「ホコリが…」とかよりまず、可愛いが勝ってしまう。猫は自分の魅力をおそらく知っているであろう、賢い生き物である…。

PCに座り、「何か問題でも?」と言いたげな視線。



とりあえずPCにロックをかけ、愛でる。本当に仕事にならない笑。

紙ならいけるかと思い、今度はノートとペンを机の上に広げてみた。すると…! 今度はそのノートの上にどっかりと座るではないか。ノートも猫ホイホイになる。またしても勉強できない。ジジの完全勝利であった。思う存分なでなでし、猫吸いもし放題なので、もはや私も楽しむことに専念した。猫は無臭に近いけどほのかにいい香りがする。うーん、最高。

最終的に、私が持ってきていたPC用のフェルトケースを置いたらそこにどかりと座ってくれた。長方形で周囲と色が違うものなら、とりあえずそこに座ってみたくなるのだろうか…? 箱に入りたくなるような感じで。一瞬フェルトで爪を研ぎ始めたが、「そ、それだけはやめてー」と言ったらやめてくれた。お利口。かくして、30 cm隣でジジが寝ている状態でPC作業ができた。至福の時間だった。猫がいる在宅ワークの生活ってこんな感じなんだな。これはたまらないなあーー。しかも、寝ているところを撫でると小さく「ミャン」とか反応してくれるのが愛い。猫もなんだかんだ、人の気配が恋しいんだなと思った。


ノート、ペンにも興味津々!



数時間も経つと、ジジは人との時間を十分に摂ったと思ったのか、少し離れた本棚へ移動。私の姿が見える場所ではある。そこでまたお昼寝。きっとそこでいつも寝ているんだろうと思われるような、ジジのスペースが開けられている本棚だった。私がトイレに行ったりキッチンへ行ったりすると目で追いかけたりついてきたりする。か、かわゆすぎだ…。

しかも、その本棚で寝ている間、ジジの手を撫でると、そのまま私の指を両手で掴んで昼寝を続けるではないか! 人の手を握って寝ていたいとは…! 人間の赤ちゃんも顔負けである。なんて可愛いんだろう。文字通り心臓がギュン!となった。

ついに来た夕方だったが、「帰らないで」アピールは前日よりは弱かった気がする。満足してくれたのだろうか。

ときめきっぱなしの「ジジのお世話大作戦」であった…。

ジジが幸せに暮らしていることも嬉しかったし、私のことを覚えているのかいないのかわからないけど、めちゃくちゃ懐いてくれたし、ジジの寂しさを癒すのに貢献できたことで、私の心もほくほくの2日間だった。

ジジは無事にその後家族と再会し、きっとちょっと拗ねながらもすぐゴロニャンして、日常が戻ってきたのだと思う。

貴重な体験で、非常にありがたかった。全世界の保護犬・保護猫に幸あれ。






7.29.2026

三井邸の桔梗を見てきた!

こんなにたくさんの桔梗をいっぺんに見たのは初めてかもしれない…! 庭に面した和室で、ぽけ〜〜っと桔梗鑑賞を楽しみました。名付けて桔梗瞑想。

蕾が星型なのが大変かわいい⭐️







 


7.28.2026

タイサンボクとクチナシ。

タイサンボクは香りもいいし花も大きくて気に入ったなぁ〜これを庭に植えるなんてロマンがある。と思ったら、高さ20 m くらいになった例もあるそうで。近隣の方々の日照権侵害になるやもしれぬ、と取らぬ狸の皮算用の逆バージョンをすることになった。


タイサンボク。人の顔くらいの大きさ。芳しい香り。

だんだん花弁が落ちて…

こうなる。。

クチナシ(梔子)も発見。こちらもいい香り。
クチナシ。花は白いのか〜


7.27.2026

パエリアの店、ラ・レチェ。おいしかった!

五条堀川のパエリアのお店に行った。人少なめでゆっくりできるし料理が最高においしかった!涼しくなったらまた行きたい。

La leche

https://maps.app.goo.gl/u96qTnLaTmQemoHWA






7.26.2026

気温が40Cに……

寒いくらいに涼しかった6月の気温から打って変わって、危険な蒸し暑さの7月であった… 40℃って。

7月

6月
雨で最高気温23℃の日なんかふつーに肌寒かったのにな…。